تکیه کلام آقا مهدی در برخورد با اکثر افراد «الله بنده‌سی» یعنی «بنده خدا» بود. او کلمه «مؤمن خدا» را نیز زیاد تکرار می‌کرد. تکیه کلام برادرش حمید نیز همین بود. باکری همه رزمندگان و همه فرماندهان و همه انسان‌ها را بندگان خداوند بزرگ می‌دانست بنابراین سعی می‌کرد که با خوشرویی با همه روبرو شود. او از دو بیماری به دور بود؛ یکی سوء ظن نسبت به دیگران و دوم خود بزرگ بینی و تحقیر دیگران و یا کوچک شمردن انسان‌ها.
در اثنای جنگ و در نیمه دوم سال ۱۳۶۱ مسئولین وقت سپاه آذربایجان تلاش زیادی داشتند تا فرد دیگری را بجای آقا مهدی به فرماندهی لشکر عاشورا بگمارند. حتی فرمانده وقت سپاه منطقه پنج، در تاریخ ۲۱/۹/۱۳۶۱ حکمی را برای فرد دیگری [شهید مرتضی یاغچیان] بجای مهدی باکری جهت تصدی فرماندهی لشکر ۳۱ عاشورا صادر کرد*. البته به نظر می‌رسید که وی بدون هماهنگی با فرمانده کل سپاه دست به چنین اقدامی زده بود. وقتی مسئولین سپاه منطقه پنج این مسئله را با من مطرح کردند، به شدت با آن مخالفت کردم و نظر مخالف خود را هم با فرمانده کل سپاه در میان گذاشتم. ولی وقتی فرمانده سپاه منطقه پنج که خود عملا در میدان‌های جنگ حضور نداشت موفق به تغییر آقا مهدی نشد، افرادی را برای مسئولیت‌های ستادی و ارکان لشکر به فرماندهی لشکر تحمیل کرد. آقا مهدی در این شرایط به گونه‌ای رفتار کرد که این افراد جدید آنقدر جذب در اخلاق آقا مهدی شده بودند که از طرف مسئولین وقت سپاه آذربایجان مورد بازخواست قرار می‌گرفتند که چرا شما تبدیل به یکی از نیروهای آقا مهدی شده‌اید؟ آقا مهدی هیچگاه این افراد تحمیلی را به عنوان غیر خودی تلقی نمی‌کرد بلکه آنها را بندگان خدا می‌دانست که می‌توانستند از این فرصت برای فعال شدن در جبهه‌های جنگ استفاده نمایند.
باکری فردی بود که از رفتار و کردار و گفتار خود مراقبت زیادی می‌کرد تا بنده خدا باشد. گر چه کم حرف بود ولی به هنگام سخن، بسیار سنجیده کلام خود را بیان می‌کرد. فروتنی او باعث شده بود که بسیاری نمی‌دانستند که او یک مهندس برجسته است.

(منبع: مهدی باکری در اندیشه و عمل، حسین علایی، چاپ اول، ص ۱۱۶ - ۱۱۵)

* این در حالی بوده است که همزمان، مهدی باکری از طرف فرمانده کل سپاه حکم فرماندهی لشکر عاشورا را دریافت کرده بود. جایی خواندم که شهید مرتضی یاغچیان بعد از گرفتن حکم فرماندهی لشکر، آنرا به نزد آقا مهدی آورده بود و اعلام کرده بود که آقا مهدی را فرمانده خود می‌داند. شهید مرتضی یاغچیان در عملیات خیبر در حالیکه جانشین لشکر عاشورا بود به شهادت رسید. درجاتشان متعالی.

بقلم تبریزی